Langli beherbergt den wichtigsten Brutvogelbestand im gesamten dänischen Wattenmeer und ist zusammen mit den angrenzenden Wattflächen auch einer der wichtigsten Rast- und Nahrungssuchplätze für große Mengen von Zugvögeln während der Zugzeiten.
Zum Schutz der Vogelwelt wird auf der Insel intensiv gegen Füchse vorgegangen, und seit vielen Jahren wurde keine andere Form der Naturschutzarbeit auf der Insel durchgeführt als die Bekämpfung von Füchsen. Eine Beweidung der Insel hat seit 1967 nicht mehr stattgefunden.
Die Dünen sind mit Gras bewachsen, und es gibt ausgedehnte Strandwiesen auf den flacheren Teilen der Insel, wo auch feuchte Moosniederungen und mehrere kleine Wasserlöcher zu finden sind.